Landskapsregeringen ansvarar för genomförande av eller är samarbetspart i en rad program med finansiering från Europeiska struktur- och investeringsfonderna där åländska företag, föreningar, myndigheter med flera kan söka finansiering för t.ex. egna aktiviteter eller samarbete.

Nuvarande programperiod sträcker sig över åren 2014-2020 och de program som näringsavdelningen förvaltar eller arbetar med är:

• Landsbygdsutvecklingsprogrammet
• Europeiska havs- och fiskerifonden
• Ålands strukturfondsprogram Entreprenörskap och kompetens
• Interreg-programmet Cental Baltic 2014-2020